(.....前文省略)
經歷整套流程後，敝人有以下數點意見，請貴部相關人員參考：
1.目前網站內容必須使用IE瀏覽器方能正常顯示及使用所有功能，在適用性上應考慮民眾使用其他瀏覽器的可能。IE市占率迅速下降中，身為政府機關網站，應公平對待，使用通用網頁語言，不應單單圖利微軟。
2.作業流程說明圖太過簡化，未說明各階段預計作業時間，亦未說明各階段產出文件，民眾得到資訊有限，只能痴痴的等待。建議每階段可再另行提供細項作業流程圖，讓民眾了解各階段內又分為那些細項作業。
3.公司名稱預查因處理時間較快，約一日內即有回音，較無問題。商業設立與商業登記時程較長，網站上「案件辦理進度」卻太過簡化。網站上只顯示「審查中」或「補正」。補正是要補甚麼文件、承辦人是誰? email也無任何說明、簡訊也無任何說明，到頭來還是要民眾自行打電話問。
4.「Q&A問答集」僅以PDF格式提供閱讀，如何能保證包含所有民眾在使用上會發生的問題? 為何不開放民眾自行提出問題，由建置單位解答，並可加入知識庫，供日後他人查詢?
5.至國稅局領取核准函及相關文件後，是否整個流程即結束，還是另外還有其他作業，流程說明圖均未說明。
6.經由民眾憑證加簽認證後的電子文件，傳到某單位某承辦人後，在該承辦人收件時，是否可自動回傳承辦人相關聯絡資料，不管是網站上顯示，或是經由email/簡訊通知均可。當文件再後傳至下一階段時亦同，民眾可經由前第1點所言之細項作業流程圖，比對目前進度。如此方才能達到預期效益第三點之「...透過即時回應系統，讓申請人於同一網站可查詢各階段辦理情形。」
7.國稅局來電詢問為何未送相關文件，但明明相關文件電子檔均已上傳，也經公司設立登記機關使用無誤，為何國稅局未收到？登記機關公文副本電子文件亦註明寄交國稅局等相關單位，是否電子文件寄送過程中有遺漏？個人及公司隱私是否有被駭或外洩之虞？
8.同上，相關部會對於電子文件流向無法整合，是否教育訓練不足？此舉顯示此網站並未達成預期效益第三點之「...於申請人相關資料建置1次，即能帶到其他相關表格資料中，無需重複填寫；對於應檢附之證明文件，透過橫向聯繫資料傳輸，盡量避免申請人再繳納相同文件」
9.既便是今日(6/25)，在民眾已親至國稅局領回商業登記核准之相關文件，整起案件流程已全數作業完畢後的數週，上列網站卻依舊顯示該作業狀態為「審理中」。提供不正確的資訊給民眾，又如何能讓民眾信服？
10.一件基本公司設立的案件，利用上列網站申請，結果在公司設立登記部分，需親送件紙本1次+領件1次，在商業登記部分，又需親送件紙本1次+領件1次，與原紙本送件舟車往返的次數相同，若是透過郵寄，就更加曠日廢時，完全未增加民眾的便利性。反而因為透過上列網站申請，民眾新增加了須將相關文件掃描、上傳的手續，便民卻變成擾民。
11.政府各機關所需之憑證元件，是否可以整合？許多作業如上列網站均為一次式作業，何必要在民眾電腦內留下「到此一遊」的足跡？即便是重複性作業，例如所得稅繳交、營業稅申報、勞保作業、健保作業...等，應整合在同一套政府專用元件包裡，避免增加電子垃圾。
